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米拉虽然死于阿多洛斯之手，但却成功唤醒了神野的记忆，可惜神野打算独自迎战达鲁卡帝国军，不想与翔太等人并肩作战。另一方面，在瓦鲁根死后，达鲁卡帝国这次则派出了黑魔导士，兴趣是收集各行星人种。在激战过程中，翔太等人虽然以幻星神大帝成功击败黑魔导士所派出的黑暗巨兽巴哈德古，但恶魔骑士却不慎落入对方手中……
神野不慎被黑魔导士关进水晶之中，而将他视为伙伴的翔太一行人，则是开始思考营救的计划。此时，阿多洛斯交付一项新的任务给黑魔导士，要他设法夺取小澪身上的正义水晶；得知敌人的企图之后，小澪等人决定将计就计，以正义水晶为诱饵，藉机救回了神野，而获救之后的神野也终于打开心房……
黑魔导士失败后，阿多洛斯这次派出了亚美里昂，同时让宇宙巨兽里奥盖阿斯复活，并赐与它全新的武器——异次元光波炮，打算让碍事的幻星神永远徘徊在宇宙的边缘，以便夺取幻星之石与正义水晶。就在翔太等人即将随着雷零守一起被拉进黑洞之际，幽暗之星出现并救了众人，而翔太等人也因此得知幻神星灭亡的悲剧……
为了避免恶魔骑士与幻星神联手构成更大的威胁，阿多洛斯司令官这次使出了卑劣的离间计谋，他命令亚美里昂假扮恶魔骑士，并且对真也发动攻击，让原本考虑信任并接受神野的真也等人感到受骗，让双方的关系一度紧张！所幸在危急之际，真假恶魔骑士双双现身，也让众人明白这是敌人的诡计，反而促使四人更加同心协力。
阿彻为了约会，将姊姊的独生子和也托给翔太照顾。得知和也是因为母亲住院才变得郁郁寡欢，翔太一行人想尽办法要逗他开心，让他打起精神来，想不到阿多洛斯却再度派出传奇战士．阿鲁苗鲁前来夺取正义水晶，也让无辜的和也无端卷入这场纷争。所幸最后成功击败敌人，而和也也因为这件事重拾笑容。
神野为了搜寻敌人的秘密基地，已经离开长达一个礼拜的时间，而且音讯全无，让翔太等人不禁开始担心他的安危。想不到健一的一句话，却让毫无头绪的众人顺利找到了神野的所在位置，真也更在千钧一发之际解除了神野的逼命危机。而这个事件，也让神野逐渐打开心房，彼此之间变得比以前更加团结。
看到理绪收到贴心男友送的手表，让由加羡慕不已。翔太见状，当天就决定开始打工存钱，打算也买一支手表送给由加当礼物。另一方面，狠毒的阿多洛斯这次则是让哈迪斯的干部——佐拉博士以及巴克斯将军复活，打算藉由两人的力量夺取正义水晶与幻星之石。正当众人奋战之际，翔太却因为见到偶像松坂直人而听不见由加等人的呼叫，后来虽然赶到，可惜还是救不了由加。正当众人感到悲痛之际，翔太的变身器却突然发出红光包住了由加……
翔太为了救由加而失去了变身器。眼看达鲁卡即将进军地球，自己却偏偏什么忙都帮不上，让翔太感到非常沮丧。这时候，格斗家松坂直人的一席话，让翔太产生了无比的勇气。另一方面，向来擅于分析的真也则是开始分析自己与影丽星神、恶魔骑士的武器与绝招，以因应红莲星神不在的情况。就在此时，巴克斯与佐拉为了报仇前来，众人在少了红莲星神的情况下展开一场苦战，不过正义水晶却显得不太寻常……
敌人再度将运送宇宙巨兽的船舱送进了地球，得知消息的翔太众人打算在怪兽现身之前来个先下手为强，想不到却在现场遭到国防军队的围攻，最后铩羽而归，满腔怒火的翔太于是决定直接找国防部把事情说清楚。就在此时，传来怪兽现身科学技术中心的消息，翔太等人随即前往处理，不料却又再度遭到国防军队的攻击，原来特务局长白河的身体早已被阿多洛斯所占据……