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当阴以量子意识形态进入太阳、掌握住弥漫整个恒星系的光晶能量体系时，这个世界文明的未来就和异界来客们关系不大了。
在这种情况下，即使是夜也无法对量子系统进行大范围的观测或干涉。不如说，她现在几乎是被彻底地排除在外，无时无刻不与阴延伸出来的意志相冲突。如此情景其实也是在这位妙人的算计之中，若是她携带的能量属性和刚刚诞生的“阴阳系统”过于契合，那她还走不走得了就两说了……
总之，原本就以偷渡形式来到这个世界的安晴等人…此刻皆是处于非法滞留的特殊状态。她们不光无法在这个地球上补充光晶，而且体内的储量也只会随着时间逸散消融。
在这些异界旅客离去后，阴会尽可能地在人世间掩盖她们的存在痕迹。本来这种世界干涉就是颇为忌讳的一件事，但是夜女士的玩兴一旦上来了……
能挡住她的两个人，现在都不在这个世界呢～
但是对于这次异界干涉事件的当事人们来说，一切都是无法被质疑的真实与过往。
原来的秋水艾德鲁小姐，即现在的佛瑞斯特子爵正在引导着新政权体系的建立。像她这种与另一个世界的自己达成共识、互帮互助的例子还是相当少见的，通过折扇开关切换人格主导的“技术”也是独一无二。
虽然从“自己”那里或稀有史料中得知了不少有关文明发展的“教材”，但秋水等贵族们也不可能一口气跃迁到最先进的政治体系。一切历史都是时间沙粒的堆积，即便是神明眷顾的文明也要一步又一步地前进。
和母亲联络了一段感情、搞清楚自己的童年记忆修改是怎么回事后，哈鲁再度回到了查尔斯所居住的乡间小镇。不再受光晶困扰的朱莉娅已经基本恢复健康，但常年的积病还是让她的身子骨弱于常人。在父亲与密友的陪伴下，终有一天她能够像普通人一样独立地生活。
作为名义上的义兄，银自然是在空闲时节来往于村子与城市之间。永远会与他随行的一位女士，正是不知道从哪里听来“成熟的外表会让人更快成长”（莱萨：“嘘～”）的金。两人之间的感情陪伴多过爱恋，但这种羁绊有时却是更加持久温馨。
他们现在专注于为转成人形的变异生物们提供就业岗位，并为“新人类”与“纯人类”之间的纷争进行协调。其实在光晶使用被阴严格约束的情况下，大部分的纷扰也不过是小打小闹罢了。
原为“银灰色”的两人虽然算不得实力最强，但他们在新人类阵营中还是有着不少盟友的。其中最显眼的是一位容貌艳丽、气质天成的美丽少女，还有一名提着鱼缸到处游荡的沉稳少年。
少年气质老成，手中鱼缸像是包裹了海底世界的缩影一般。其中珊瑚礁群内有着那么一条自在生活、无忧无虑的小丑鱼，他游动时偶尔眼里会闪过一丝淡淡的银光。
拉瑞萨、卢西恩等人暂时利用着“圣灵”教会的根基，并通过它潜移默化地改变着人们的思想概念。全新印发的教义中，“圣灵”们不再是那么高高在上、冷漠无情的存在，而是就围绕在我们身边、每人心中潜藏的善良。
渊府小镇周遭的森林在不知不觉中与其他人类社会接壤，作为新任镇长的陈木肩上重担也是多了几分。但这位青年自己倒没怎么感到疲惫，前几天他刚刚跑来黎明城，把所有跟育儿备产相关的书籍都借了回去。
至于他到底是怎么奇迹般地死而复生…那就要问问那些百年来一直徘徊在小镇周围的“幽灵”们了。
一切生命的生活似乎都变得好了起来，即使是对于那些千年前便逝去的冤魂来说，也是一样……
托马斯安德森并没有在这场“世界再创”中收获死亡。作为所做恶事的惩罚，他所有的光晶能量都被阴回收了，而这也导致了一件意料之外的事情……
他失忆了。准确的说，丢失的是他进入“五六七大裂谷”之后的所有记忆。
就算是足智多谋的夜女士也不太确定这种现象的原因。根据秋水的辅助分析，有可能千年前在安德森体内诞生的“智核生命”并不是他本人意识的延伸。因此，当这份寄托于光晶核心的千年执念被抹去后，安德森也就恢复成了他当年的人格。
由于大部分人类都搞不清楚他的身份，知情者们干脆就让他换了个名字——尼欧，重新以“时空穿越者”的名义进行生活。这个新名字寓意着开始与起源，也是不需要过多向外人解释的东西……
作为监视和陪伴，帅大猛被指派到尼欧现在生存的小镇，与他在同一间加工厂里做活。与大多数的新人类一样，帅大猛如今的外貌也不过是一个普普通通、身高两米的少年。他的原本外壳被直接废铁回收了，如今正作为几个新卫星挂在天上。
不知道是不是创造者与创造物的天然亲近作祟，尼欧和帅大猛很快就成了相当要好的朋友。他们共同研究出来的机械车辆为文明重建工作做出了重大贡献，对自己“过去”毫不知情的尼欧也是无比惬意地生活着。
漫长的时间之中，仇恨与偏见终将消散一空。如何排解“幽灵”恶劣情绪的方法夜已经全盘告知了阴，就是不知道这个人类与“圣灵”共存的社会能健康运行多久呢？
曾经夜也以为自己所在的世界、由赫利俄斯系统掌握的太阳系是完善无缺的。纵然无法达到完美，但为所有人类提供庇护应该还是能做到的吧？
然后自由城系统的建立就“啪”的一声打了她的脸。
那么这百年来“现实”中的种种错误又该如何纠正呢？总之绝对不能依赖于虚无缥缈的异界来客。
它们终将化为文明的坚固基石。